感染症、伝染病の項も参照のこと。

• 病原体による分類：真正細菌、ウイルス、真菌、原生生物、寄生虫、ウイロイド、プリオンなど
• 侵入門戸による分類：経口感染、経気道感染、経皮感染、創傷感染、接触感染、尿路感染、粘膜感染、胎盤感染など
• 感染経路による分類：食物感染、水系感染、空気感染、飛沫感染、ベクター感染、血液感染、母乳感染、産道感染など
• 発病時期による分類：急性感染、亜急性感染、慢性感染、遅発性感染など
• 感染部位による分類：全身感染、局所感染、異所性感染、表在性感染、深在性感染、細胞内感染など
• 伝染様式による分類：垂直感染（母児感染）、水平感染