女性または男性のどちらか、あるいは両方が性行為を拒むために不妊となる場合がある。性教育、強姦、家庭環境など、精神的なことが理由となり性行為を拒絶する場合が多い。その他、身体的理由、仕事を理由とした場合もある。いずれも性行為が出来るように解決してから不妊治療に挑むべきではあるが、性行為を嫌悪している者は、自分が異常であると認識していることが少ない、または認めようとしないことが多い。不妊治療を担当する医師の問診では、夫婦間性交渉は通常どおり行っているかのように報告したり、性行為はしていないと明確に伝え開き直るなど、本人達が解決する意思が無いこともある。解決することは非常に難しいとされる。現在はこれに関するデータを取得することは好ましくないという風潮がある。

不妊の診断については、一般の健康調査に加え、血液分析によるホルモン量の調査、精液の調査などが行われる。男性不妊のうち、精子の運動性不足・貧精子症・無精子症などは精液の検査によって診断が可能である。 またY遺伝子上の問題も不妊に関与していることから、PCR法による診断が試みられている。 女性不妊については、甲状腺刺激ホルモン量・女性ホルモン量の分析・女性生殖器の診断などが行われる。 性行為の嫌悪による不妊については、原因を解決することは不妊治療の専門外であることが多く、問診のみで高度不妊治療が実施されることが多い。