直径約300nmの球形である。約1040kbの環状DNAを持つほか、7.5kbのプラスミドを持つ。

他の感染性を示すクラミジアに見られないものとして、グリコーゲンと葉酸を合成するということがある。

性状の違いから生物型LGV、生物型Trachoma、生物型Mouseの大きく3つの生物型に分けることができる（ただし生物型Mouseは別種という説あり）。ヒトに病原性を示すのは生物型LGVと生物型Trachomaの2種である。血清型はA,B,Ba,C,D,D7,E,F,G,H,I,I',J,K,L1,L2,L2',L3の18ある。